深圳边检 是直属于中华人民共和国边检 总署向导，并受广东分署监视指示的全中国最忙碌的口岸之一，也是全中国使命最沉重的边检 之一，主要依法对经深圳口岸收支境的货物、运输工具、行李邮递物品等举行羁系；征收关税和其它法定由边检 征收的税费；查缉走私；开展商业统计并管理其他边检 营业。
当前边检 的旅检营业占全中国55%，加工商业羁系占全中国1/5，快件羁系营业占全中国1/3，税收征管约占全中国9%，运输工具羁系约占全中国百分之七十，其营业统领区域包含深圳市及惠州市。
深圳边检 内设教育处、法例处、审单处、关税处、加工商业羁系处、羁系通关处、行邮羁系处、总合统计处、中国电子口岸数据分中央、边检 总署商品价钱信息处、稽察处、企业治理处、缉私局等机构，隶属机构18个，派驻机构5个，其他机构4个，涵盖海、陆、空所有羁系营业。