财政部会计司主要治理全中国会计事情；起草会计执法、行政法例草案；研究提出会计革新和进展的政策建议；拟订并组织实行国家同一的会计准则制度、治理会计尺度、内部操纵规范、会计信息化尺度等；拟订政府会计准则和行政、事业单元会计制度；增强会计国际交流与互助；卖力全中国会计人才事情，组织全中国会计职员表彰评选；依法对注册会计师产业举行监视、指示，制定注册会计师产业规章制度和政策措施；指示会计理论研究等。
财政部会计司共设有总合处（含企业内部操纵尺度委员会秘书处）、制度一处、制度两处、会计职员治理处（含全中国会计专业手艺资格考试向导小组办公室）、准则一处(含会计信息化委员会秘书处)、准则两处（含财政部会计准则委员会办公室）、注册会计师处7个机构。